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黄于艺,陈惠芳,何颖等.中国龙虾Pan s 1抗原表位研究及相关虾蟹类蛋白进化分析[J].现代仪器与医疗,2013,19(1):1-4.
doi:
标题:
中国龙虾Pan s 1抗原表位研究及相关虾蟹类蛋白进化分析
作者:
黄于艺,陈惠芳,何颖,邹泽红,陶爱林
作者单位:
摘要:
在Uniprot数据库中获得中国龙虾过敏原Pan s 1蛋白序列,使用DNAStar和NetMHCⅡ分别预测B细胞和T细胞表位,并对其进行抗原性评分;使用Swiss-Model软件生成其三维结构,并利用Ramachandran plot分析进行模型有效性评估。在Uniprot数据库搜集不同种类的虾蟹原肌球蛋白序列,利用MEGA5.1用JTT+G模型构建ML(Maximum Likelihood)进化树。结果显示,中国龙虾过敏原Pan s 1 三维结构为2条相互缠绕的α-螺旋。Pan s 1的B/T细胞共有抗原表位区域为81~95,146~157。同体型大小的虾蟹类之间,可能更为容易产生种群间的交叉过敏反应。
关键词:    中国龙虾;Pans1;抗原表位;进化分析
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